V roce 1996 byla z důvodu odbornosti provedena výměna vedoucích pracovišť. Vedoucím pracoviště oprav přístrojů a zařízení se stal p.Zdeněk Halaksa a vedoucím střediska technického dozoru p.Ing. Michal Škoda.

Po splnění všech stanovených předpokladů byl podle § 19 zákona o metrologii č.505/1990 Sb. Opravárenský závod v dubnu 1996 registrován u Českým metrologickým institutem jako subjekt provádějící opravy a montáže měřidel veličin v atomové a jaderné fyzice typových řad DC, RP a VDD.

V červenci 1997 jsme byli svědky usilovné snahy člověka omezit ničivé účinky živelné pohromy POVODNÍ, zachránit občany v zaplavených oblastech, snížit následná rizika a pomoci navrátit do lidských obydlí přerušený život. Z pověření HÚCO byl ředitel závodu určen jako styčný důstojník pro koordinaci činnosti francouzských specialistů, kteří se mezi prvními evropskými záchranáři, po dohodě s MZV, zapojili do pomoci ČR. Jednalo se o 60ti člennou skupinu odborníků na úpravu pitné vody. Pod vedením tehdejšího náměstka ředitele byli všichni pracovníci závodu zařazeni do skladů Základny logistiky v Drahanovicích a Vizovicích, kde se ve směnných provozech podíleli na příjmu humanitární pomoci od občanů a firem.

Koncem roku 1997 a začátkem roku 1998 byla činnost závodu zaměřena kromě, odborných úkolů, na likvidaci nepoužitelného zaplaveného materiálu CO, jak PIO, tak i dozimetrických přístrojů, které obsahovaly zářiče.

V roce 1998 dochází k přerozdělení objektu kasáren a ředitelství závodu je přestěhováno z budovy č.2 do budovy č.11 současné dislokace závodu. Jsou dobudovány kanceláře a sociální zařízení.

V březnu 1999 je splněn stěžejní úkol a to schválení typu měřidla, kdy byla u radiometru DC-3E-83 provedena modernizace na typ DC-3E-98. Toto měřidlo bylo v souladu se zákonem č. 505/1990 určeno stanoveným měřidlem odpovídajícím všem paragrafům uvedeného zákona a stanovených norem.

Dále v tomto období bylo podle dalšího dělení CO na vojenskou a nevojenskou část provedeno oplocení závodu. Na pracovišti zkušebnictví PIO byla vybudována dílna na zkoušení dětských vaků, umývárna a sušárny ochranných masek.

Současně byl závodu stanoven úkol na provedení úprav vystřelovacího zařízení na chemické technice UAZ záchranných pluků CO tak, aby odpovídalo požadavkům Stanag 02 v rámci interoperability.

V květnu 1999 je závod autorizován podle §16 zákona č. 505/1990 Sb. o metrologii Úřadem pro technickou normalizaci, metrologii a státní zkušebnictví, jako státní metrologické středisko pro ověřování měřidel ionizujícího záření.

Až do roku 2001 plnil závod úkoly stanovené metrologickým řádem CO a úkoly technického odborného dozoru u vyhrazených elektrických, tlakových a zvedacích zařízení, především u vojenské části CO.

Na tyto pracoviště a činnosti měl opravárenský závod vydána platná osvědčení, včetně kalibračního střediska elektrických veličin. Na těchto činnostech měl největší podíl Ing.Lubomír Fryc, Ing.Michal Škoda, p.Josef Rosulek, Vladimír Nečesaný a Dalibor Donda.